Kurz rozšiřuje znalosti získané v kurzu Počítačové modelování částicových soustav I o hlubší teoretický popis opírající se o znalosti termodynamiky a statistické fyziky, což umožní výklad rozšířit o metody Monte Carlo (MC) a hlubší výklad potřebný pro implementaci vlastních simulačních programů. Výsledkem každého cvičení bude vytvoření vlastního simulačního programu využívajícího metod vyložených v rámci předcházejících přednášek. Cílem kurzu je rozvinout schopnost studentů vytvářet vlastní simulační programy a vyvíjet nové vlastní postupy v oblasti částicových simulací: